判断工厂扣工资是否违法，需注意特殊情况对结果的影响，具体如下：
1. 员工因个人原因（如故意或重大过失）给工厂造成经济损失，且双方在劳动合同中明确约定了赔偿方式（如从工资中逐月扣除），工厂可按约定扣减工资，但每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%，且剩余工资不得低于当地最低工资标准。此时扣工资合法，员工需承担赔偿责任。
2. 若工厂规章制度未依法公示或告知员工（如未通过民主程序制定、未张贴公告或组织学习签字等），即便以此为由扣工资，该制度对员工不具约束力，工厂扣工资行为违法，员工有权要求返还。
3. 员工因不可抗力或紧急情况（如突发疾病住院并履行请假手续、自然灾害导致无法按时上班等）无法正常工作，工厂扣减工资属违法行为，员工有权要求支付该期间正常工资。
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被工厂扣工资不仅会造成经济损失，还可能带来法律风险，具体如下：
1. 证据链风险：劳动者若无法充分证明工厂扣工资的事实及自身工资标准，可能维权失败。例如，小王未签书面劳动合同，工资以现金形式发放且无工资条，工厂无故扣减工资后，因无法证明劳动关系和被扣金额，劳动仲裁因证据不足败诉。
2. 诉讼时效风险：劳动仲裁时效为一年，未及时维权可能因超时效导致权利无法受法律保护。例如，小李2022年5月发现3月工资被克扣，但未及时处理，2023年6月才申请仲裁，已超一年时效，仲裁机构可能不予受理或驳回。
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针对您询问的被工厂扣工资是否违法问题，结合法律依据分析如下：
《中华人民共和国劳动法》第五十条明确规定：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”这里的“不得克扣”要求工厂扣工资必须有“合法理由”，无合法依据的扣减均属违法。
同时，《中华人民共和国劳动合同法》第八十五条规定，用人单位未按劳动合同约定或国家规定及时足额支付劳动报酬的，劳动行政部门可责令限期支付，逾期不支付需加付赔偿金。若工厂无法证明扣工资理由符合法律规定（如员工造成损失且有赔偿约定、违反规章制度且制度已公示等），则扣工资行为违法，您有权要求工厂返还被扣工资并承担法律责任。
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判断工厂扣工资是否违法，需看扣工资的具体理由是否合法。
工厂扣工资不一定违法，但无故扣减则违法。
1. 若工厂能提供合法有效的规章制度或劳动合同约定，且扣工资理由符合《劳动法》《劳动合同法》等规定（如员工因个人原因造成经济损失、违反劳动纪律等），扣工资行为可能合法；
2. 若工厂无合法依据，擅自以“罚款”“违约金”等名义扣减工资，或扣减后工资低于当地最低工资标准，属违法行为；
3. 若工厂扣减工资比例超过法定限度（如员工因个人原因给单位造成损失，每月扣除部分不得超过当月工资的20%，且剩余工资不得低于当地月最低工资标准），超出部分也属违法。

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